准确地预测某一热性惊厥能否出现后遗症，是否会变为癫痫，有一定困难。但根据一些“危险因素”进行估计是有一定帮助的。
若热性惊厥首次发作是单纯性的，且惊厥前神经系统正常，则癫痫的发生率为1%；在热性惊厥前已有神经系统异常或为复杂性高热惊厥，则癫痫发生率为2%～ 3%；若热性惊厥前神经系统已有异常而且为复杂性发作，则癫痫的发生率为9%。并且有报道，热性惊厥病儿如有围产期异常，当转变为癫痫时往往是全身性发作。而另一些热性惊厥的小儿，惊厥时间长，反复发作，或局限性发作，以后转变为癫痫时，往往表现为精神运动型癫痫。
总之热性惊厥一般预后良好，仅有极少部分患者可转变为癫痫，留有后遗症，其发生率为热性惊厥的2%～7%。当热性惊厥患儿出现以下危险因素时，预示转变为癫痫的百分率增高。
(1)复杂性高热惊厥，发作时间长约15分钟，限局性发作，低于38℃时发作，一次热病连续发作。
(2)热性惊厥多次复发。
(3)热性惊厥前有神经系统异常、发育异常、智力低下或围产期异常。
(4)首次发作在1岁以内。
(5)家中有癫痫或热性惊厥史。